Et marinetoilet er konstrueret til brug om bord og betjenes via en manuel eller elektrisk pumpe, der skyller med søvand. Affaldet ledes typisk til en holdingtank, da direkte udledning kystnært er forbudt. Systemet er sårbart over for fremmedlegemer; undgå derfor andet end letopløseligt papir i kummen for at forhindre blokeringer af pumpemekanikken.
Luk altid tilhørende søventiler under sejlads og i hårdt vejr for at eliminere risikoen for vandindtrængen via slangesystemet.